Liehovar Auchentoshan bol postavený v roku 1823. Pôvodný liehovar postavil a prevádzkoval obchodník s obilím John Bulloch a jeho syn. Po ich bankrote v roku 1834 bol liehovar predaný miestnemu farmárovi Alexandrovi Filshiemu, ktorý ho po neúrode v roku 1877 predal liehovarníkom Johnovi a Georgeovi MacLachlanovcom z Glasgowa. Kráter po bombe za liehovarom, ktorý vznikol počas druhej svetovej vojny, sa v súčasnosti používa ako chladiaca nádrž na vodu. V roku 1969 liehovar kúpila spoločnosť Eadie Cairns, ktorá ho kompletne prestavala. V roku 1984 Cairns predal spoločnosť Auchentoshan výrobcovi whisky Stanleymu P. Morrisonovi. Spoločnosť Suntory investovala do spoločnosti Morrison Bowmore v roku 1989 a v roku 1994 získala 100 % jej akcií. V máji 2014 sa spoločnosti Beam Inc. a Suntory Holdings Limited zlúčili do spoločnosti Beam Suntory Inc, ktorá teraz vlastní spoločnosť Auchentoshan a ďalšie podiely spoločnosti Morrison Bowmore.
Spoločnosť Auchentoshan používa trojitú destiláciu, čo je pre škótsku pálenicu nezvyčajné. V záverečnej fáze výroby škótskej whisky sa skvasený rmut zvyčajne destiluje v dvoch medených kotloch. V spoločnosti Auchentoshan pomáha tretí destilačný prístroj (nazývaný “Intermediate Still”) dosiahnuť konečný obsah alkoholu 81 %. Výsledkom je jemnejšia a sladšia chuť. Zrenie prebieha prevažne v sudoch po bourbone a sherry, hoci časť vína Auchentoshan zreje vo francúzskych vínnych sudoch.
Z času na čas sa vydávajú špeciálne fľaše vrátane najstaršej, 50-ročnej edície destilovanej v roku 1957 a vydanej v roku 2008. V liehovare sa nachádza aj návštevnícke centrum a konferenčné miestnosti, ktoré boli dokončené v roku 2005. Pre širokú verejnosť sa organizujú prehliadky každý deň v týždni.